Zalety akwaponiki to m.in. produkcja ekologicznej żywności, minimalne zużycie wody czy redukcja odpadów trafiających do środowiska.
Na świecie jest coraz mniej wody, a jednocześnie coraz więcej ludzi, którzy potrzebują zdrowej, świeżej żywności. Także w Polsce deficyt słodkiej wody jest coraz większy – mieszkańcy zużywają jej więcej, niż jest się w stanie odtworzyć w naturalny sposób. Tymczasem rolnictwo w tradycyjnej formie pochłania niemal 70% zasobów. Dodatkowo do 2050 r. 2/3 mieszkańców będzie żyło w miastach. Dlatego już teraz warto produkować żywność blisko odbiorcy, bo skraca to łańcuch dostaw i ogranicza ślad węglowy. Rozwiązaniem może być akwoponika, czyli system łączący konwencjonalną hodowlę zwierząt wodnych z uprawianiem roślin w wodzie w sposób odzwierciedlający obieg materii w naturze.